1975年12月19日，澳葡政府以705/75號法令提升澳門司法警察廳為澳門司法警察司。澳門司法警察司在行政上直屬澳門總督，而在刑事訴訟的運作上由葡萄牙檢察長指導。為了明確司法警察司的運作，1979年8月4日澳門立法會頒布了第19/79/M號法律，即司法警察司組織法，規定司法警察司為一負責刑事偵查、犯罪預防及協助司法當局的直屬澳門總督的警察部門，在進行刑事偵查時接受檢察院的指導，但有權對所有不予起訴的案件進行歸檔。司法警察司司長由法院或檢察院的司法官出任，副司長一職也於1986年通過的第34/86/M號法令規定，必須由澳門總督在法院或檢察院的司法官，或一等督察，或至少從事法律工作五年的法學士中任命。

　 1999年12月20日，隨著澳門回歸祖國，司法警察司更名為司法警察局，隸屬澳門特別行政區保安司，但在刑事調查工作中接受檢察院領導。局長和副局長的任職條件與回歸前相同。

　 隨著特區政府重新調整博彩政策，以及近年中央政府對內地居民到港澳特區旅遊的新政策，帶動澳門整體經濟持續良好發展。為配合社會發展需要，特區政府於2006年制定和頒布第5/2006號法律和第9/2006號行政法規，重新規範了司法警察局的專屬調查權限，將清洗黑錢犯罪、資訊犯罪和恐怖主義犯罪納入司法警察局的專屬調查權限範圍，並調整了組織架構，將博彩罪案調查處提升為博彩及經濟罪案調查廳，將組織、資訊暨電訊處提升為資訊及電訊協調廳，並把司法鑑定化驗所更名為刑事技術廳。