毒品罪案調查處隸屬刑事調查廳，主要職責為預防和調查第5/2006號法律第七條第一款規定之犯罪行為人不明且可處最高限度超逾三年徒刑之犯罪，與販賣麻醉品及精神科物質有關的犯罪。

有組織罪案調查處隸屬刑事調查廳，主要職責為預防和調查第5/2006號法律第七條第一款規定的犯罪行為人不明且可處最高限度超逾三年徒刑的犯罪，剝奪他人行動自由罪，使人為奴隸罪，挾持人質罪，犯罪集團罪或黑社會罪，向用作出賽的動物不法使用物質的犯罪，以及恐怖主義犯罪等。

侵犯人身罪案調查科（第一科）隸屬刑事調查廳，主要負責調查涉及侵犯人身方面的罪案，特別是兇殺、侵犯身體完整性、強姦、綁架等犯罪。

侵犯財物罪案調查科（第二科）隸屬刑事調查廳，主要負責調查所有權方面的犯罪，如各種盜竊罪、毀損罪、侵佔不動產罪等。

搶劫罪案調查科（第四科）隸屬刑事調查廳，主要負責調查所有用暴力侵犯所有權的罪案，如搶劫罪、勒索罪等。

縱火罪案調查科直接隸屬刑事調查廳，主要負責調查造成火警、爆炸及其他特別危險行為之犯罪等。

刑事資料暨技術科隸屬刑事調查廳，主要負責有關刑事資料的記錄、管理，相關設備的操作及向刑事偵查部門提供協助等工作，按職務範圍設有資料記錄檔案室、刑事攝影室和指紋鑑定室。